區間線路出留仙洞站后,沿同發路前行,下穿深圳市職業技術學院運動場后轉入沙河西路,沿沙河西路下穿西麗水庫-鐵崗水庫引水隧道,并旁穿西麗水庫飲用水水源保護區,然后進入白芒站。該區間可以分為兩大類地層,一類以硬塑性粘性土、全風化花崗巖為主,適宜采用土壓平衡模式掘進;另一類以微風化/中風化花崗巖為主,適宜采用敞開模式掘進。
區間自大運站出發后,沿龍崗大道下方敷設,下穿寶荷深惠立交橋、地鐵三號線高架橋、愛聯小區B區及新屯工業園,然后往東北向拐入如意路下方敷設,下穿龍崗河、惠鹽高速公路、排背圍村房屋進入山體,出山體后下穿澳美世家家具廠、福昌電子科技股份有限公司,最后沿寶荷路敷設,下穿廈深鐵路到達寶荷站。
區間自小菜園站出站后沿米軌鐵路通道敷設,側穿小菜園立交橋后繼續沿著米軌鋪設穿越盤龍江,在YDK9+ 400~ YDK9+ 570段,區間隧道線性由并行過渡到重疊段,左右線垂向.上相距1.8m,在YDK9+ 834~ YDK9 + 883段穿越北京路最后抵達火車北站隧道。主要地層為圓礫、礫砂、粉砂、粘土層。
區間線路出鶴洞東站后,沿芳村大道由北往南前行,以350m左偏曲線,下穿廣州造船廠,橫穿珠江后,下穿南石二街居民住房后進入南石路站,出南石路站后,下穿廣紙幼兒園、宿舍樓,往東下穿工業大道和廣佛線進入燕崗站。主要穿越地層為中風化泥質粉砂巖、微風化中粗砂巖、含礫砂巖。
區間線路主要沿中山大道鋪設,側穿廠房、住宅樓、加油站、軍事區、廣州運營事業總部,下穿顯子寶橋、A219高橋、BRT蓮溪站、BRT茅崗站及其人行天橋等建(構)筑物。區間主要穿越地層為強~弱風化砂巖、含礫砂巖,強~弱風化泥質粉砂巖。
該區間位于錦城大道下方,該段區間交通繁忙,線路從孵化園站出發后沿錦城大道向西- -直前行,下穿經過益州大道路口、成雙南路路口后于成都市高新公證處前方到達元華站。主要地層為中密卵石土,強風化泥巖,局部有中等風化泥巖。